Foi especificamente projetado e construído de acordo com os mais modernos sistemas de climatização e filtragem de ar com pressurização positiva, apropriados a processos micro-químicos super limpos, imprescindíveis aos métodos de geocronologia e geologia isotópica.

Módulo de Química: contém espaços separados para: purificação de água e ácidos; solubilização das amostras e padrões a serem analisados; separação dos elementos por meio de colunas com resinas de troca iônica em capelas de fluxo laminar; e pesagem meio de micro-balanças analíticas.

Módulo de Espectrometria de Massa: abriga o Espectrômetro de Massa propriamente dito, onde são realizadas medições de razões isotópicas, além de instrumental para montagem e degasificação de filamentos e para depósito das amostras em filamento.

O LAGIR dispõe ainda de duas casas de máquinas que abrigam os sistemas "fan-coil" que promovem a pré-filtragem (por filtros do tipo manta e bolsa), a refrigeração e a renovação do ar laboratorial, mantendo a pressão interna positiva em relação ao meio exterior.

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